Peter Wünnenberg je študiral na Visoki šoli za umetnost v Berlinu pri prof. Koji Toyoda. Tukaj je tudi opravil mojstrske tečaje pri pomembnih glasbenikih, kot so Rainer Kussmaul, Yfrah Neaman in Valery Gradow. Bil je član študentskega orkestra Mlada nemška filharmonija in Evropskega komornega orkestra. Po zaposlitvi v Simfoničnem orkestru Münster je Peter Wünnenberg od leta 1995 član orkestra Komične opere v Berlinu.

Kot solist in član komornih orkestrov je nastopal že na dunajskem festivalu Wiener Festwochen, na Vivaldijevem festivalu v Epinalu, v ZDA, Južni Ameriki, Bližnjem in Daljnem vzhodu. Njegov glasbeni spekter zajema tudi področje stare glasbe. Intenzivno se posveča zgodovinskim instrumentom in je svoje znanje izpopolnil tudi s študijem baročne violine pri Elizabeth Wallfisch v Londonu.